Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HPGDP15428 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HPGDP15428 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPGDP15428 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPGDP15428 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPGDP15428 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPGDP15428 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPGDP15428 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPGDP15428 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPGDP15428 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPGDP15428 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPGDP15428 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPGDP15428 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPGDP15428 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HPGDP15428 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPGDP15428 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPGDP15428 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPGDP15428 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPGDP15428 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPGDP15428 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPGDP15428 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HPGDP15428 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms