Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms