Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNJ1O43426 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNJ1O43426 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms