Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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RAB23Q9ULC3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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RAB23Q9ULC3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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RAB23Q9ULC3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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RAB23Q9ULC3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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