Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms