Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSD3Q9BZ95 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms