Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTRT3Q9BYD9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms