Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELP4Q96EB1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELP4Q96EB1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms