Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms