Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HIST3H3Q16695 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HIST3H3Q16695 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms