Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms