Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RUNX3Q13761 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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