Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms