Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms