Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms