Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DSC2Q02487 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms