Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P62684 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P62684 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms