Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRATP43155 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms