Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBX2P40425 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBX2P40425 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBX2P40425 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBX2P40425 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBX2P40425 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBX2P40425 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBX2P40425 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PBX2P40425 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBX2P40425 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBX2P40425 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PBX2P40425 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PBX2P40425 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PBX2P40425 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PBX2P40425 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PBX2P40425 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PBX2P40425 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PBX2P40425 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PBX2P40425 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PBX2P40425 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PBX2P40425 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PBX2P40425 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PBX2P40425 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PBX2P40425 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PBX2P40425 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PBX2P40425 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PBX2P40425 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms