Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTX2P32243 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTX2P32243 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms