Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms