Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms