Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB1P08034 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJB1P08034 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJB1P08034 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms