Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms