Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KNSTRNQ9Y448 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNSTRNQ9Y448 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms