Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM35Q9UPQ4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms