Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLIP2Q9UDT6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLIP2Q9UDT6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLIP2Q9UDT6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLIP2Q9UDT6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLIP2Q9UDT6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLIP2Q9UDT6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLIP2Q9UDT6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLIP2Q9UDT6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLIP2Q9UDT6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLIP2Q9UDT6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLIP2Q9UDT6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLIP2Q9UDT6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLIP2Q9UDT6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLIP2Q9UDT6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms