Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL42Q9P2K6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms