Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Odf2lQ9D478 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Odf2lQ9D478 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Odf2lQ9D478 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Odf2lQ9D478 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Odf2lQ9D478 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Odf2lQ9D478 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Odf2lQ9D478 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2lQ9D478 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Odf2lQ9D478 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Odf2lQ9D478 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2lQ9D478 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2lQ9D478 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2lQ9D478 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2lQ9D478 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Odf2lQ9D478 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2lQ9D478 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2lQ9D478 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2lQ9D478 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2lQ9D478 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2lQ9D478 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2lQ9D478 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2lQ9D478 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Odf2lQ9D478 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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