Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM8Q9BZR9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms