Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PUS3Q9BZE2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms