Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms