Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAGR1Q9BTK6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms