Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms