Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPNS2Q96L46 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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