Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113Q902F9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms