Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
NLRP13Q86W25 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP13Q86W25 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms