Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VSTM1Q6UX27 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms