Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms