Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00303Q3SY05 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms