Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CA9Q16790 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CA9Q16790 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CA9Q16790 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CA9Q16790 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CA9Q16790 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CA9Q16790 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CA9Q16790 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CA9Q16790 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CA9Q16790 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CA9Q16790 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CA9Q16790 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CA9Q16790 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CA9Q16790 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CA9Q16790 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CA9Q16790 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CA9Q16790 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CA9Q16790 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CA9Q16790 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CA9Q16790 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CA9Q16790 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CA9Q16790 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CA9Q16790 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CA9Q16790 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CA9Q16790 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CA9Q16790 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CA9Q16790 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CA9Q16790 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms