Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CYTH1Q15438 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYTH1Q15438 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms