Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECTIN1Q15223 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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