Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2H3Q13889 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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