Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOFQ13790 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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APOFQ13790 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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APOFQ13790 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOFQ13790 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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