Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FOXE3Q13461 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FOXE3Q13461 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FOXE3Q13461 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FOXE3Q13461 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FOXE3Q13461 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FOXE3Q13461 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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FOXE3Q13461 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FOXE3Q13461 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXE3Q13461 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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