Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F1Q01094 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms