Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COG7P83436 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COG7P83436 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COG7P83436 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COG7P83436 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COG7P83436 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COG7P83436 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COG7P83436 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COG7P83436 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COG7P83436 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COG7P83436 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COG7P83436 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COG7P83436 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COG7P83436 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COG7P83436 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COG7P83436 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COG7P83436 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COG7P83436 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COG7P83436 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COG7P83436 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms