Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRMP28827 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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PTPRMP28827 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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PTPRMP28827 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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PTPRMP28827 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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PTPRMP28827 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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PTPRMP28827 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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PTPRMP28827 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
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PTPRMP28827 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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PTPRMP28827 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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PTPRMP28827 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRMP28827 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
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