Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LMO2P25791 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMO2P25791 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMO2P25791 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMO2P25791 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms